Michel Houdebine, polytechnicien et diplômé de l’ENSAE, a débuté sa carrière à l’Insee en 1995. En 1999, il y est responsable des prévisions de finances publiques de moyen terme à la Direction de la Prévision.

En 2001-2002, il rejoint la direction des relations économiques extérieures (DREE) où il occupe les fonctions de Chef du bureau “échanges et investissement”.
En 2004, il intègre la Direction générale du Trésor où il occupe successivement les postes de conseiller économique du Directeur du Trésor, Chef du bureau “analyse macroéconomique internationale » et, parallèlement, il est Secrétaire général de la Commission économique de la nation et de la Conférence économique annuelle, de 2006 à 2008. Il y est ensuite nommé Sous-directeur des affaires européennes puis Chef du service des politiques publiques.
En septembre 2015, Michel Houdebine est nommé Chef économiste à la Direction générale du Trésor.
Michel Houdebine en 2019 est nommé Conseiller-maître à la Cour des Comptes