Diplômé de l'Institut d'Etudes Politiques de Paris et titulaire d’un Diplôme d’Etudes Approfondies en économie, Thierry Philipponnat débute une carrière dans la finance en 1985. Il occupera différentes fonctions en banque commerciale et d'investissement durant les vingt années suivantes avant de devenir en 2004 directeur de l’activité dérivés actions d'Euronext.liffe et membre des comités exécutifs d'Euronext à Paris et du LIFFE à Londres.

Après avoir quitté le secteur financier, il rejoint le monde des ONG, faisant campagne au nom d'Amnesty International avec un accent particulier sur la responsabilité sociale des entreprises et sur l'impact du secteur financier sur les droits humains. Il est ensuite élu membre du bureau exécutif d'Amnesty International France.

En 2011, il co-fonde l'ONG européenne Finance Watch à Bruxelles, qu'il dirige en tant que premier secrétaire général jusqu'en 2014. Par la suite, il devient président du Forum français pour l'investissement responsable (FIR), membre du conseil d'administration du European Sustainable Investment Forum (EUROSIF) et directeur du think tank économique Institut Friedland. En octobre 2019 Thierry Philipponnat rejoint Finance Watch en tant que responsable de la recherche et du plaidoyer et il en devient le chef économiste en janvier 2022.

Thierry Philipponnat est membre de la commission des sanctions de l'Autorité de Contrôle Prudentiel et de Résolution (ACPR) ainsi que de sa commission climat et finance durable et de son comité scientifique.

Entre 2013 et 2022, il a été membre du collège de l'Autorité des Marchés Financiers (AMF) où il a également présidé la commission climat et finance durable et la commission consultative marchés. Il a été membre de 2020 à 2022 de la première plateforme de la Commission européenne sur la finance durable. Il est aujourd’hui membre du «Sustainability Reporting Board» de l’EFRAG.

Il est l'auteur de plusieurs ouvrages et de nombreux rapports et articles sur la finance, la régulation financière, la finance durable, le lien entre stabilité financière et risque climatique, l'investissement socialement responsable et la responsabilité sociétale des entreprises.